Новые методы диагностики на основе технологий секвенирования 

Руководитель научной группы разработки новых методов диагностики на основе технологий секвенирования ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов считает:

«Два новых варианта коронавируса, обозначенные как сублинии Омикрона BA.4 и BA.5, были идентифицированы в ходе мониторинга за генетической изменчивостью SARS-CoV-2. ВОЗ уже заявила, что начала отслеживать их из-за их дополнительных мутаций, которые могут повлиять на потенциал ускользания от иммунитета.

Сублиния BA.4 имеет все те же мутации, что и BA.2, за некоторым исключением. Так, вернулась делеция 69/70, которая была у BA.1, и из-за отсутствия которой BA.2 получила название “стелс-омикрон”. Кстати, именно за нее “цеплялись” специальные ПЦР-тесты, позволяющие выявлять штамм Омикрон на ранних стадиях распространения варианта. Есть также специфическая мутация L452R, которая присутствовала в вариантах Дельта, Каппа и Эпсилон, и ответственная за весьма неприятные свойства той же Дельты, вызвавшей очень большое число летальных исходов по всему миру в 2021 году. Линия BA.5 в основном имеет те же мутации/делеции, что и BA.4, с небольшими отличиями.

Самый ранний образец BA.4 в базе данных GISAID был из Южной Африки с датой забора мазка 10 января 2022 года. Страны, сообщившие о BA.4 через базу данных GISAID (всего обнаружено более 100 случаев), теперь включают Южную Африку (большинство загруженных геномов), Данию, Ботсвану, Англию, Шотландию, Австрию, Бельгию, Германию. Геномов BA.5 в GISAID загружено более 150. География - все та же Южная Африка, Индия, Непал, Израиль, и ряд Европейских стран. И хотя общее количество геномов BA.4/BA.5 в базе данных невелико, немногим менее 300, их широкое географическое распространение предполагает, что вариант достаточно успешно передается между людьми, и потому мониторинг за циркуляцией штаммов остается важной составляющей в нашем понимании эволюции вируса и необходимости адаптации диагностических тестов и вакцинных препаратов к новым вариантам, если это станет необходимым.

В России сублинии BA.4 и BA.5 - не обнаружены; более 90% всех новых случаев сейчас приходятся на заражения субвариантом BA.2, при этом BA.1 становится все более редким гостем».

Пресс-служба Роспотребнадзора 

Медицинское информационное агентство «Здоровье и защита пациентов: новости здравоохранения, медицины